Program Studi Farmasi UMM berdiri sejak  tahun 2006 melalui Surat Ijin Pendirian dari Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional RI, Nomor: 1964/D/T/2006 dan Rekomendasi pembukaan Program Studi Farmasi UMM dari Departemen Kesehatan Republik Indonesia Badan Pengembangan Dan Pemberdayaan Sumberdaya Manusia Kesehatan, Nomor : HK.03.2.4.1.02342.1, tertanggal 15 Mei 2006. Sebagai Program Studi baru, Program Studi Farmasi UMM dibina oleh Fakultas Farmasi Universitas Airlangga Surabaya melalui MoU Nomor: 100/Jo3.1.20/PP/2006 dan E.S.c/359/BAA-UMM/V/2006. Program Studi Farmasi UMM diadakaan dalam rangka merealisasi program Indonesia Sehat sebagai upaya antisipasi kebutuhan tenaga kesehatan khususnya Apoteker. Saat ini  Program Studi Farmasi UMM telah terakreditasi mulai dari tahun 2009 berdasarkan Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi, No.028/BAN-PT/Ak-XII/S1/IX/2009. Akreditasi terbaru pada tahun 2023 berdasarkan Keputusan  Lembaga Akreditasi Mandiri Pendidikan Tinggi Kesehatan Indonesia dengan hasil Baik Sekali. Sejak 15 Oktober 2009 menjadi anggota Asosiasi Perguruan Tinggi Farmasi Indonesia (APTFI).